日本发生严重地震、海啸后，国航驻日本地区的各工作机构临危不乱，迅速召开内派和当地职员会议，安定人心，同时做好分工，从国内派驻人员全部留守，各司其职，由日本地区总经理李明荣负责总指挥，3月15日开始进驻成田机场，地区副总经理马世泉进驻羽田机场，进行24小时应急处理。3月16日至19日4天，国航在成田机场、羽田机场共投入航班33个，座位8015个，运送旅客7473人，客座率93.2%，同时与驻日使馆配合，在机场临时接收从重灾区撤出的中国公民2511人，受到了在日华人和驻日大使馆的广泛赞誉。
在重点保障从重灾区撤出中国公民的加班飞行的同时，对正常航班的保障也在有序进行。从3月20日开始，日本出发客人已经逐渐趋于平稳，总经理李明荣、副总经理马世泉回到东京的工作岗位。3月21日是公休日（日本清明节），凌晨就开始下雨后转成大雨，日本政府告诫国民最好呆在家里躲避核辐射，因雨水会把核辐射物浇落到地面。东京大街上行人寥寥无几。但国航驻日本营业部总部和东京营业部的员工还是主动来到公司加班，特别是呼叫中心部门的7位员工全部到岗，忙碌地接听电话，办理各项业务，售票柜台和座位控制的4名员工也按时到岗上班。国内派驻人员以身作则的敬业精神，极大地鼓舞了日本地区所有员工的士气，大家同心协力，共渡难关，全力以赴保证中日间航班畅通。
地震之后，随着福岛核电站的不安全因素的增加，以东京为中心的日本关东地区也表现出了极大的慌乱。超市里瓶装水、米、面、面包、牛奶、鸡蛋、方便食品等被横扫一空，燃油供应不上，电力公司分时分片限电，各种不安定因素造成人心惶惶。在日本的华人也开始大批量撤离，特别是使馆组织的地震最严重的日本东北几个县的中国公民开始大规模撤离。
国航在羽田机场人手严重不足，加上航站负责的一位内派人员只有7人，这期间还临时抽调了一位去成田机场帮忙。早班航班虽然取消，但有部分客人通知不到，所以国航在羽田5点半开柜台，工作人员5点前就要到岗位。中午有1点半出发的正常航班，晚上的加班到晚上9点半才会出发，飞机走后，回到办公室要准备第二天的航班，一般到23点才会结束。这期间工作人员基本来不及进餐，只是统一买点面包、三明治之类的快餐，甚至这些都来不及进口，只能喝点水。羽田内派航站负责人卢方连续工作两周时间，累得趴在桌子上睡着，有的当地员工身体不舒服，本来安排第二天休息，但因为人手不够，休息半天马上赶到岗位投入工作，实在顶不住的时候，就倒在椅子上休息几分钟。
仙台机场被地震引发的海啸摧毁后，国航仙台营业部的7名雇员还是坚持全部到岗上班，有的走路，有的骑自行车，有的搭车去上班。在他们的努力下，在市内及机场办公室的设备都得到了保护。名古屋营业部邮寄给仙台营业部方便面、牛奶和一些干粮，保证了他们的基本生活。他们还买了几辆自行车来解决上班的交通困难。由于通讯不畅，他们通过邮件乐观地告诉总部，只要机场恢复，他们随时可以进入工作状态。
地震发生以来，国航在日的工作人员和机场一线员工共同进退，应对非常时刻，在保障正常航班运营的同时，还为加班飞行提供地面支持，大大加快了滞留同胞的疏散速度。
图为国航领导慰问日本营业部员工
图为等待回国的重灾区中国公民
国航日本营业部员工虽然工作超负荷但仍然保持着良好的工作状态
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